1、操作方式不同：逆回购虽然本质上也是一种质押贷款，但是通过“先买后卖”来完成的，即先买入有价证券，到期后再将其卖出;MLF是央行直接以质押的方式向商业银行提供贷款。

2、期限不同：逆回购一般以三天、七天、十四天居多，而MLF的期限一般在3-6个月。

3、作用不同：逆回购的主要目的在于提供流动性，而MLF还有调节利率的作用。