海航班高考加分视学员在综合考核中的表现而定，具体0到60分不等。在高二暑假之前，每个海航班的学员都必须到山东、辽宁的航校，参加高二年级的综合考核。该项综合考核为上机操作考试，即专业飞行员在前面飞，学员则在后面做相同的演示。通过这个上机飞行考核，学员可获得0到60分的飞行加分。飞行加分10分为一档，主要根据学员的表现而定。

这样的飞行加分不仅可用于海军飞行学员的录取考核，后期被淘汰的学员也依然可以在普通高考中使用这项加分。考核中符合条件的学员录取为海军飞行学员，特别优异的可录取为海军和清华大学、北京大学、北京航空航天大学联合培养的“双学籍”飞行学员。